Tenttiwiki

Molekyyligenetiikan luentokuulustelu

16.12.2010

  1. Metyloidun DNA:n merkitys a) bakteereilla, b) eukaryooteilla. (10 p)
  2. Kuvaa lyhyesti a) TFIIH:n osuus transkription aloituksessa eukaryooteilla (5 p), b) Geenien säätely kromatiinirakenteen muutosten avulla (5 p)
  3. Anteriori-posteriori (etu-takapään) akselin kehityksen sekä jaokkeenmuodostuksen geneettinen säätely banaanikärpäsellä (10 p)

8.2.2010

1. Kuvaa lyhyesti a) TFIIH:n osuus transkription aloituksessa eukaryooteilla (5p) b) Geenien säätely kromatiinirakenteen muutosten avulla (5p)

2. Translaation initiaatio bakteereilla (10p)

3. Anteriori-posteriori (etu-takapään) akselin kehityksen sekä jaokkeenmuodostuksen geneettinen säätely banaanikärpäsellä (10p)

10.12.2008

  1. Millä eri tavoin lopputuote voi vaikuttaa biosynteettisen operonin ekspressioon? Selvitä lyhyesti mekanismien toimintaa. (10p.)
  2. Kuvaa lyhyesti (enintään ½ sivua/kysymys!) a) okazaki-fragmenttien yhdistäminen eukaryoottien replikaatiossa (3p.) b) Kromatiinimuutokset geenien säätelyssä (3p.)
  3. Määrittele/selitä lyhyesti (à 2p) a) jaokkeen ja valejaokkeen ero banaanikärpäsellä, b)nukleoidi, c)geneettinen redundanssi, d) Minkälainen on C. elegansin egl-1 mutantin fenotyyppi?, e) Ranskan lippu -malli solujen kommunikaatiossa.

5.2.2008

  1. Excision repair -mekanismi (10p)
  2. Transkription initiaatio eukaryoottien mRNA:ta tuottavilla geeneillä.
  3. Määrittele lyhyesti (á 2p):
  • Banaanikärpäsen UAS-GAL4 -menetelmän periaate
  • Nukleoidi
  • Geneettinen redundanssi
  • Mitä yhteistä on C. elegansin ced-3 ja ced-4 mutanttien fenotyypeissä?
  • Hiirigenetiikassa käytettävän Cre-Lox -menetelmän toimintaperiaate

12.12.2007

  1. Miten bakteerien geenejä voidaan säädellä RNA:n avulla?
  2. Transkription initiaatio eukaryoottien mRNA:ta tuottavilla geeneillä.
  3. Määrittele/selitä lyhyesti (á 2 p):
  • Millä olennaisella tavalla Notch signalointi eroaa muista yleisistä signalointireiteistä?
  • balanserikromosomit
  • Mitä tarkoitetaan C-arvon paradoksilla?
  • “forward” ja “reverse” genetiikan erot
  • Hiirigenetiikassa käytettävän Cre-Lox menetelmän toimintaperiaate.

13.12.2006

  1. Vertaile keskenään eukaryoottien ja E. colin replikaaseja sekä replikaaseja avustavia proteiineja (10 p)
  2. a) Millä periaatteella positiivinen ja negatiivinen geenisäätely tapahtuvat geeniekspression induktio- ja repressiotilanteissa? Mainitse muutamia prokaryootteihin liittyviä esimerkkejä (5p) b) Kerro lyhyesti neljä tapaa, joilla RNA voi vaikuttaa bakteerin geeniekspression säätelyyn (5 p)
  3. Määrittele/selitä lyhyesti (á 2 p):
  • Banaanikärpäsen UAS-GAL4 menetelmän periaate
  • Balanserikromosomit
  • geneettinen redundanssi
  • “forward” ja “reverse” genetiikan erot
  • satelliitti DNA

7.2.2006

Vastaa kolmeen kysymykseen (á 10 p) / Answer to three of the following questions (10 cr each)

1. Selitä lyhyesti / explain shortly (2-3 rivillä / lines)

  • a) Faasivariaatio / phase variation
  • b) Geenikonversio / gene conversion
  • c) Hollidayn liitos / Holliday junction
  • d) Chi-välitteinen rekombinaatio / Chi-dependent recombination
  • e) Central dogma / central dogma
  • f) Allosteerinen säätelijä / allosteric regulator
  • g) Operaattori / operator
  • h) Induktori / inductor
  • i) Repressori / repressor
  • j) Korepressori / corepressor

2. Translaation initiaatio bakteereilla / initiation of translation in bacteria

3. Vastaa molempiin kysymyksiin / answer both questions:

  • a) Miten tehdään tietyn geenin suhteen poistogeeninen hiirilinja? / How to create a gene-spesific knock-out mouse line?
  • b) Miten voidaan tutkia mikroRNA:iden kudosspesifistä ilmentymistä? / How to study tissuespecific expression on microRNAs?

4. Kuvaa TFIIH:n rakenne ja sen osuus transkription aloituksesta / Describe the structure of TFIIH and its role in initiation of transcription